国家临床重点专科（中医类）、国家中医药管理局重点学科、国家中医药管理局重点专科、国家中医优势专科（肾病科）、江西省中医肾病临床医学研究中心、江西省中西医结合肾病诊疗中心、江西省中医肾病临床研究基地、江西省慢性肾衰病区域诊疗中心、江西省中医优势病种肾衰病防治中心、江西省红蝴蝶疮（狼疮性肾炎）重点研究室、九江市肾病医院、九江市临床重点专科、九江市肾脏病重点实验室、九江市肾脏病学专业医疗质量控制中心和九江市医学会肾脏病学分会挂靠单位等。
下设肾病1科、肾病2科、肾病3科、肾病5科、肾病6科、血液透析科、肾病实验室、肾脏病理室，编制床位300张，血透机137台，患者来自23个省市自治区及海外华侨，阜外患者比例达60%。专科充分挖掘中医药特色优势，建设了慢性肾衰病（慢性肾衰竭）、水肿病（肾病综合征）、肾风病（IgA肾病）等中医优势病种，研制了排毒保肾丸、养阴益肾颗粒、益气固摄浓缩丸、肾石颗粒等院内制剂，广泛使用中药汤剂口服、穴位贴敷、中药灌肠、艾灸、中药熏蒸等治疗各种肾脏病，创立的中西医结合“四联疗法”治疗难治性肾病综合征疗效显著。近5年“养血祛瘀泄浊法延缓慢性肾衰竭进展技术的创建与应用”获江西省科技进步二等奖，立项国家自然科学基金1项、省部级课题4项、市厅级课题100余项，发表SCI及各级期刊论文100余篇，主编或参编著作8部等。
九江市骨科医院以中西医结合临床骨科医疗为主，兼有骨科疾病预防保健、科研、教学等；为骨科患者提供全方面临床医疗、预防保健、急诊救助服务，并根据卫生行政部门要求，参与突发公共卫生事件医疗救助。
骨科医院是国家中医药管理局重点专科，国家中医优势专科建设单位，江西省腰椎间盘突出症区域治疗中心，上海中医药大学附属龙华医院、南部战区总医院骨伤技术协作单位。江西省人民医院骨质疏松及骨病诊疗协作单位，南昌大学一附院骨科医院专科医联体单位。医院设有创伤骨科、关节骨科、脊柱骨科、手外科、小儿骨科、中医正骨及颈肩腰腿痛科、筋伤科等7个临床病区，设有骨科研究室和骨科3D打印实验室，开放床位405张；医院现有骨科专业副高以上职称医师27人；省、市级骨伤名医3人，省、市骨科学科带头人2人。
骨科医院经过多年的临床实践和科学研究，颈肩腰腿痛中医传统治疗特色优势明显，尤其是对脊柱、骨关节疾病及创伤骨折的中西医结合治疗；特别在腰椎间盘突出症（腰痛病）的治疗中，制定了详实的诊疗规范、护理规范。采用“骨科超市”模式运用传统中医治疗方法+现代微创技术及手术相结合，形成了鲜明的中医治疗特色。辐射赣北及湖北、安徽、湖南等周边省市，具有较高的知名度。
重症医学科目前设置病床13张，医生7名、护士26名。其中副主任医师3名，副主任护师1名，其中硕士研究生1名。科室配备呼吸机、床边血气仪、电动病床、空气消毒机、亚低温治疗仪、输液微量泵、振动式物理治疗仪、动静脉脉冲气压治疗仪、红外线治疗仪、中频电脉冲治疗仪、床旁彩色多普勒超声机、床旁纤维支气管镜等先进设备。
科室开展了枸橼酸体外抗凝床旁血滤治疗、有创/无创机械通气支持，鼻空肠管置管，肠内、肠外营养支持，有创血流动力学管理，床旁纤维支气管镜检查和治疗，床旁彩超引导下中心静脉、胸腔、腹腔穿刺置管术。科室针对危重患者开展了耳穴埋豆、穴位贴敷、下肢功能锻炼、芒硝外敷、中药擦浴等具特色中医护理治疗，并且针对重症肺炎、脓毒血症制定了有中医治疗特色的临床路径。
